Hacettepe Üniversitesi İngilizce Tıp Fakültesi’nden 1999 yılında mezuniyeti takiben aynı üniversitede Üroloji Anabilim Dalı’nda 1999-2004 yılları arasında Üroloi ihtisasımı tamamladım. Yardımcı doçent olarak 2005 yılında Eciyes Üniversitesi Tıp Fakültesi Üroloji Ana Bilim Dalı’nda çalışmaya başladım. 2006 yılında bir yıl süre ile Manisa Asker Hastanesi’nde yedek subay olarak görev yaptım. 2011 yılı başında Doçent ünvanını aldım ve, Nisan 2011 tarihinden itibaren Acıbadem Kayseri Hastanesi Üroloji Kliniği’nde göreve başladı. Ekim 2021 tarihinde Acıbadem İnternational Hastanesi İstanbul’da görev yapmaya başladı. Şu an Prof. Dr. Mustafa Sofikerim, yeni hizmete giren Acıbadem Ataşehir Hastane kompleksinde tam gün görev yapmaktadır.