Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi’ nden 1989 yılında mezun olduktan sonra Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi KBB Anabilim Dalı’ nda başladığı Kulak Burun Boğaz İhtisas eğitimini 1994 yılında tamamlamıştır. 1995 yılında Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Kulak Burun Boğaz Anabilim Dalı’ nda Öğretim Görevlisi Uzman olarak çalışmaya başlamış ve 1994-1998 yılları arasında Dokuz Eylül Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Odyoloji Bilim Dalı’ nda Yüksek Lisansını (MSc) tamamlamıştır. 1998 yılında Yardımcı Doçent, 2000 yılında Doçent, 2006 yılında Profesör olmuştur.Prof. Dr. Enis Alpin Güneri 2009- 2011 tarihleri arasında Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi KBB Anabilim Dalı Başkanlığı görevini yürütmüştür.